Mnogi ljudi smatraju to vrlo zahtjevnim i ponekad preskoče određenu dozu ili je uzimaju prekasno.

Alergijska reakcija može uzrokovati nuspojave kao što su osip ili groznica. Kod svake sumnje da je došlo do alergijske reakcije, treba odmah kontaktirati sa svojim liječnikom. Neke alergijske reakcije vrlo su opasne, pa prije korištenja bilo kojeg lijeka treba pažljivo pročitati upute te voditi računa o nuspojavama.

Mnogi antiretrovirusni lijekovi izazivaju mučninu. Čak i neki lijekovi za tretiranje popratnih infekcija vezanih uz HIV izazivaju mučninu.

Rezistencija na antiretrovirusne lijekove jedan je od najvažnijih problema s kojima se susrećemo pri liječenju HIV-bolesti.

Dobro je poznato da zdravlje usne šupljine može imati dalekosežne posljedice na opće zdravlje organizma. Zbog toga se dužna pozornost mora pokloniti stomatološkom liječenju bolesnika s HIV-bolesti.

Ispitivanje rezistentnosti provodi se u sklopu istraživanja virusa HIV-a da bi se dobila nova saznanja o razvoju rezistentnosti na antiretrovirusne lijekove.